Yıldızgemisi Atılganın yeni bir versiyonu ilk yolculuğuna çıkar ve onur konuğu, hernekadar komuta koltuğunda oturmasa da eski Kaptan Kirkten başkası değildir. Yolculuk başlar başlamaz iki gemiden yardım sinyali alırlar ve görev yine emektar kaptana düşer. Olağanüstü yeteneği ve engin tecrübesi ile Kirk, gemilerden birini kurtarmayı başarır. Savaş sırasında Kirk kaybolur ve yolculardan bir tanesi olanlardan hiç memnun değildir. İntikamını yıllar sonra almak üzere harekete geçecektir ama bu kez karşısında yeni jenerasyon Atılganın kaptanı Jean Luc Piccardı bulacaktır.

Görünen bir uyarı olmadan ortaya çıktı. Birdenbire nereden geldiği belli olmadan. Bir kaç dakika içinde Amerika’nın bir çok şehrinde sebebi açıklanamayan, kanınızı donduracak garip ölümler meydana gelmeye başladı. İnsan davranışlarındaki bu garip değişikliğe neyin sebep olduğu bilinmiyor. Yeni bir terrorist saldırı mı? Yapılan yüksek teknolojik deneylerde ters giden bir şeyler mi oldu? Bir tür şeytani toksik silah mı? Yoksa kontrolden çıkan bir virus mü? Hava yolu ile mi yoksa suyla mı bulaşıyor? … ve nasıl?