1970li yıllarda bir grup bilim insanı ve asker, Amerikan hükümetinin desteklediği bir keşif gezisi için Pasifikte insan eli değmemiş, efsanevi bir adaya çıkar. Bu cennet gibi adada devasa bir yaratığın bölgesine girdiklerini ise çok geç fark edeceklerdir. Keşif görevleri hayatta kalma savaşına dönüşürken, insanoğlunun ait olmadığı bu ilkel cennette hayatta kalmaya çalışacaklardır.

Godzilla vs Kong, canavarların düyada dolaştığı, insanlığın gelecekleri için mücadele ettiği bir zamanda, doğanın en güçlü ikilisi olan Godzilla ve Kong, daha önce hiç görülmemiş bir savaşta çarpışmasını konu ediyor. Godzilla saldırılarına başlayıp, önüne çıkar her şeyi yerle bir ettiğinde, hükümet onu durdurmak için başka bir efsaneye yönelir; King Kong. İki canavar üstünlük için karşı karşıya geldiğinde, insanlık büyük bir tehlikenin ortasında kalır. Bu sırada bir komplo, hem iyi hem de kötü tüm yaratıkları sonsuza dek yeryüzünden silmekle tehdit eder.

Eski bir MMA dövüşçüsü olan Cole Young kendisine kalan mirastan haberiz, Outworld’den gelen İmparator Shang Tsung’un en iyi savaşçısı olan Sub-Zero’nun saldırısına uğrar. Sub-Zero’nun onu avlaması için neden gönderildiğini öğrenmek için çıktığı macerada kendini bir anda Dünya’nın en iyi savaşçıları ile birlikte Outworld’den gelen savaşçılara karşı ölümcül bir dövüşe hazırlanırken bulur.