Eski bir IMF ajanı olan Sean Ambrose, Chimera adlı ölümcül bir virüsü ele geçirmeye çalışmaktadır. Virüsü ve antivirüsünü kullanarak borsayı kontrolüne alarak bir servet yapmak isteyen Ambroseun peşine Ethan Hunt düşer. Ethan, Ambroseu bulabilmek için onun eski sevgilisi Nyah Hallu kullanmaya karar verir. Ancak Nyahın büyüleyici güzelliği, Ethanın ona aşık olmasına ve önceliklerinin değişmesine sebep olur.Duygusal yönü de aksiyon dolu içeriği kadar ağır basan filmin yönetmeni, Hong Konglu aksiyon ustası John Woo. Brian De Palmanın çektiği ilk filme oldukça farklı bir devam çeken Woo, nefes kesici aksiyon sahneleriyle izleyiciyi koltuklarına çivilemeyi başarmış.

Federal Ajan Aaron Falk, intihar etmeden önce karısı ve çocuğunu öldüren çocukluk arkadaşının cenazesine katılmak için yirmi yıl önce ayrıldığı memleketine gider. Yaşananlara anlam veremeye Aaron, olayı araştırmaya karar verir. Aaron araştırma yaparken eski bir yara olan 17 yaşındaki Ellie Deaconun ölümünü de yeniden gün yüzüne çıkarır. Bu iki olayın birbiriyle bağlantılı olabileceğinden şüphelenmeye başlayan Falk, sadece arkadaşının masumiyetini değil, aynı zamanda kendi masumiyetini de kanıtlamak için çabalar.