Run, annesi tarafından herkesten ve her şeyden uzak bir şekilde yetiştirilen genç bir kızın hikayesini konu ediniyor. Tüm yaşamını dört duvar arasında geçiren genç kız, eğitimini de evde annesinden alır. Hayattaki tek varlığı annesi olan genç kızın yaşamı, annesinin korkunç bir sır sakladığını keşfetmesi ile bambaşka bir hal alır. Annesinin sakladığı sırrı öğrenmeye çalışan genç kız, korkunç gerçeklerle yüzleşmek zorunda kalacaktır.

Owen Shaw’u alt eden Dom ve ekibi artık sahip olmak istedikleri normal hayata ve Amerikaya geri dönmüşlerdir. Ancak Owen Shaw’un eskiden İngiliz ordusunda subay olan abisi Deckard Shaw, Dom ve ekibinden intikam almak için harekete geçer. İçlerinden birinin ölümünden sonra Dom, Mr. Nobody adlı üst düzey hükümet yetkilisinden Shaw’ı bulmak için yardım ister. Mr. Nobody, Tanrı’nın Gözü (Gods Eye) adlı gizli bir programı teröristlerin elinden çalmaları karşılığı Shaw’u bulmalarına yardım edeceğini söyler. Dom, ekibini tekrar toplayarak Shawu durdurmak ve programı geri almak için harekete geçer.