Donanmanın en iyi pilotlarından biri olan Pete “Maverick” Mitchell, 30 yıllık hizmetten sonra ait olduğu yerde, cesur bir test pilotu olarak sınırları zorlar ve kendisini yere bağlayacak olan terfiden kaçar. Kendisini Top Gun mezunlarından oluşan bir müfrezeyi o güne kadar hiçbir pilotun görmediği özel bir görev için eğitirken bulur. Belirsiz bir gelecekle ve geçmişinden gelen anılarla karşı karşıya kalan Maverick, en büyük korkularıyla yüzleşmek ve büyük bir fedakarlık yapmasını gerektiren bir göreve gitmek zorunda kalır.

Bir grup mahkum, ceza sürelerini kısaltabilecek, çok çeşitli etkilere sahip olan bir deneye katılır. Mahkumlara, duygularını değiştiren güçlü ilaçlar verilmektedir. Deneklerden biri, adlığı ilaç sonrası duygularından şüphe etmeye başlar. Bu durumun ardından mahkumlar, laboratuvar hakkındaki gerçekleri öğrenmek için araştırma yapmaya başlar.